Desde el punto de vista ambiental es un producto que contribuye a mantener el equilibrio en el ecosistema, ya que es el hábitat de muchas especies en peligro de extinción.

Un aspecto de vital importancia es que aproximadamente el 90% del área esta cultivada bajo sombra diversificada con árboles maderables, contribuyendo significativamente a la producción de oxígeno, producción de leña (extracción de leña de la sombra), conservación de la fauna, suelos, agua y un incremento en la biodiversidad.

La mayoría de las zonas cafetaleras de Honduras están situadas en áreas de amortiguamiento de reservas naturales contribuyendo de manera decidida a la diversidad ambiental, a la producción de agua y constituye un precioso recurso paisajístico con un alto potencial para el agro turismo.